Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCDHB6Q9Y5E3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCDHB6Q9Y5E3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCDHB6Q9Y5E3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCDHB6Q9Y5E3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PCDHB6Q9Y5E3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCDHB6Q9Y5E3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCDHB6Q9Y5E3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PCDHB6Q9Y5E3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms