Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF12Q9Y4X4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF12Q9Y4X4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF12Q9Y4X4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF12Q9Y4X4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF12Q9Y4X4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms