Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-11Q9UQG0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-11Q9UQG0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-11Q9UQG0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-11Q9UQG0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-11Q9UQG0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-11Q9UQG0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms