Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAPRE3Q9UPY8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAPRE3Q9UPY8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAPRE3Q9UPY8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAPRE3Q9UPY8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAPRE3Q9UPY8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAPRE3Q9UPY8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms