Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL21Q9UJP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL21Q9UJP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL21Q9UJP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL21Q9UJP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL21Q9UJP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL21Q9UJP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms