Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NCKIPSDQ9NZQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NCKIPSDQ9NZQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKIPSDQ9NZQ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCKIPSDQ9NZQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms