Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSD3Q9NYI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSD3Q9NYI0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSD3Q9NYI0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSD3Q9NYI0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSD3Q9NYI0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSD3Q9NYI0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSD3Q9NYI0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms