Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPANXCQ9NY87 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPANXCQ9NY87 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPANXCQ9NY87 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPANXCQ9NY87 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXCQ9NY87 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms