Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D2Q9NY47 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D2Q9NY47 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D2Q9NY47 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D2Q9NY47 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D2Q9NY47 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D2Q9NY47 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms