Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVK-5Q9HDB9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVK-5Q9HDB9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVK-5Q9HDB9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVK-5Q9HDB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-5Q9HDB9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVK-5Q9HDB9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms