Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCC2Q9HCC0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCC2Q9HCC0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC2Q9HCC0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC2Q9HCC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms