Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED28Q9H204 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED28Q9H204 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED28Q9H204 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED28Q9H204 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED28Q9H204 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED28Q9H204 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED28Q9H204 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms