Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REXO4Q9GZR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO4Q9GZR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
REXO4Q9GZR2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO4Q9GZR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO4Q9GZR2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms