Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF559Q9BR84 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF559Q9BR84 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF559Q9BR84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF559Q9BR84 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF559Q9BR84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF559Q9BR84 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms