Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOPXQ9BPY8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOPXQ9BPY8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOPXQ9BPY8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOPXQ9BPY8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOPXQ9BPY8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOPXQ9BPY8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOPXQ9BPY8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOPXQ9BPY8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOPXQ9BPY8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOPXQ9BPY8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOPXQ9BPY8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOPXQ9BPY8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOPXQ9BPY8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOPXQ9BPY8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOPXQ9BPY8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms