Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP2Q99959 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP2Q99959 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKP2Q99959 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP2Q99959 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP2Q99959 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP2Q99959 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.2 ms