Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIMP4Q99727 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP4Q99727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP4Q99727 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP4Q99727 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIMP4Q99727 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP4Q99727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms