Protein–RNA interactions for Protein: Q96T54

KCNK17, Potassium channel subfamily K member 17, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK17Q96T54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms