Protein–RNA interactions for Protein: Q96T54

KCNK17, Potassium channel subfamily K member 17, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK17Q96T54 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KCNK17Q96T54 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNK17Q96T54 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNK17Q96T54 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNK17Q96T54 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNK17Q96T54 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNK17Q96T54 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNK17Q96T54 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNK17Q96T54 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNK17Q96T54 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNK17Q96T54 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNK17Q96T54 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNK17Q96T54 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNK17Q96T54 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNK17Q96T54 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNK17Q96T54 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNK17Q96T54 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNK17Q96T54 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNK17Q96T54 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNK17Q96T54 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNK17Q96T54 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK17Q96T54 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNK17Q96T54 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK17Q96T54 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK17Q96T54 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNK17Q96T54 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNK17Q96T54 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNK17Q96T54 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNK17Q96T54 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNK17Q96T54 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK17Q96T54 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNK17Q96T54 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNK17Q96T54 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK17Q96T54 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK17Q96T54 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNK17Q96T54 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK17Q96T54 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNK17Q96T54 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNK17Q96T54 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNK17Q96T54 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNK17Q96T54 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNK17Q96T54 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNK17Q96T54 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNK17Q96T54 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNK17Q96T54 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNK17Q96T54 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNK17Q96T54 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNK17Q96T54 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNK17Q96T54 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNK17Q96T54 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNK17Q96T54 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNK17Q96T54 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNK17Q96T54 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNK17Q96T54 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNK17Q96T54 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNK17Q96T54 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNK17Q96T54 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNK17Q96T54 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNK17Q96T54 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNK17Q96T54 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNK17Q96T54 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNK17Q96T54 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNK17Q96T54 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNK17Q96T54 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNK17Q96T54 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNK17Q96T54 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNK17Q96T54 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNK17Q96T54 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNK17Q96T54 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNK17Q96T54 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNK17Q96T54 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNK17Q96T54 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNK17Q96T54 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNK17Q96T54 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNK17Q96T54 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNK17Q96T54 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK17Q96T54 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNK17Q96T54 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK17Q96T54 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNK17Q96T54 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNK17Q96T54 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK17Q96T54 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNK17Q96T54 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNK17Q96T54 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK17Q96T54 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK17Q96T54 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK17Q96T54 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK17Q96T54 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNK17Q96T54 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNK17Q96T54 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK17Q96T54 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK17Q96T54 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNK17Q96T54 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK17Q96T54 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNK17Q96T54 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK17Q96T54 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNK17Q96T54 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNK17Q96T54 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK17Q96T54 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNK17Q96T54 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms