Protein–RNA interactions for Protein: Q96P53

WDFY2, WD repeat and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY2Q96P53 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDFY2Q96P53 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDFY2Q96P53 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY2Q96P53 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDFY2Q96P53 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDFY2Q96P53 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDFY2Q96P53 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDFY2Q96P53 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms