Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD8Q96LT4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD8Q96LT4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD8Q96LT4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD8Q96LT4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMD8Q96LT4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD8Q96LT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms