Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR9

REEP6, Receptor expression-enhancing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP6Q96HR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms