Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRELD1Q96HD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRELD1Q96HD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRELD1Q96HD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRELD1Q96HD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRELD1Q96HD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRELD1Q96HD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms