Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE2Q96FN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE2Q96FN4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE2Q96FN4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE2Q96FN4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE2Q96FN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms