Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf43Q96C57 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf43Q96C57 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf43Q96C57 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C12orf43Q96C57 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf43Q96C57 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf43Q96C57 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms