Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX1Q92499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX1Q92499 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX1Q92499 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX1Q92499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX1Q92499 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX1Q92499 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms