Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC4Q8WW27 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC4Q8WW27 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC4Q8WW27 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC4Q8WW27 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC4Q8WW27 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC4Q8WW27 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC4Q8WW27 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms