Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLDC1Q8NA58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNLDC1Q8NA58 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNLDC1Q8NA58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLDC1Q8NA58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms