Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC71LQ8N9Z2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC71LQ8N9Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71LQ8N9Z2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms