Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ANKRD42Q8N9B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ANKRD42Q8N9B4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ANKRD42Q8N9B4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD42Q8N9B4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD42Q8N9B4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms