Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDCD7Q8N8D1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDCD7Q8N8D1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCD7Q8N8D1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCD7Q8N8D1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms