Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29P2Q8IUI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX29P2Q8IUI4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29P2Q8IUI4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29P2Q8IUI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX29P2Q8IUI4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms