Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPFIBP1Q86W92 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIBP1Q86W92 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIBP1Q86W92 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIBP1Q86W92 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIBP1Q86W92 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIBP1Q86W92 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIBP1Q86W92 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms