Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NANOGNBQ7Z5D8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NANOGNBQ7Z5D8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGNBQ7Z5D8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGNBQ7Z5D8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms