Protein–RNA interactions for Protein: Q7LG56

RRM2B, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2BQ7LG56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRM2BQ7LG56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM2BQ7LG56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRM2BQ7LG56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRM2BQ7LG56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM2BQ7LG56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRM2BQ7LG56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRM2BQ7LG56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms