Protein–RNA interactions for Protein: Q7L985

LINGO2, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO2Q7L985 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO2Q7L985 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO2Q7L985 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINGO2Q7L985 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO2Q7L985 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO2Q7L985 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms