Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PACS1Q6VY07 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PACS1Q6VY07 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACS1Q6VY07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACS1Q6VY07 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PACS1Q6VY07 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACS1Q6VY07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACS1Q6VY07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACS1Q6VY07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms