Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYPD4Q6UWN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LYPD4Q6UWN0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYPD4Q6UWN0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYPD4Q6UWN0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYPD4Q6UWN0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.7 ms