Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL4

KLHL24, Kelch-like protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL24Q6TFL4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL24Q6TFL4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL24Q6TFL4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL24Q6TFL4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL24Q6TFL4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL24Q6TFL4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL24Q6TFL4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms