Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKN3Q6P5Z2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKN3Q6P5Z2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKN3Q6P5Z2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN3Q6P5Z2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKN3Q6P5Z2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKN3Q6P5Z2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKN3Q6P5Z2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN3Q6P5Z2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms