Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO4Q6EEV6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO4Q6EEV6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO4Q6EEV6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO4Q6EEV6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO4Q6EEV6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms