Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP9Q5VTM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
AGAP9Q5VTM2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP9Q5VTM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP9Q5VTM2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP9Q5VTM2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms