Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRTP1Q5TC63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRTP1Q5TC63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRTP1Q5TC63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRTP1Q5TC63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRTP1Q5TC63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRTP1Q5TC63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRTP1Q5TC63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GRTP1Q5TC63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms