Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CD-AS1Q5SR53 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms