Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYI7

MTX3, Metaxin-3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTX3Q5HYI7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTX3Q5HYI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTX3Q5HYI7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTX3Q5HYI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTX3Q5HYI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTX3Q5HYI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTX3Q5HYI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms