Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC36A3Q495N2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC36A3Q495N2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC36A3Q495N2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC36A3Q495N2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A3Q495N2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms