Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1644Q3SXP7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KIAA1644Q3SXP7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KIAA1644Q3SXP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KIAA1644Q3SXP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms