Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGGHGQ32M88 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGGHGQ32M88 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGGHGQ32M88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGGHGQ32M88 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGHGQ32M88 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGGHGQ32M88 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms