Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM249Q2WGJ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM249Q2WGJ8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM249Q2WGJ8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM249Q2WGJ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM249Q2WGJ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms