Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9K0

TMEM44, Transmembrane protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM44Q2T9K0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM44Q2T9K0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM44Q2T9K0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM44Q2T9K0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM44Q2T9K0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM44Q2T9K0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms